提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
这个春节，宝岛年味浓******
兔年到来，
宝岛台湾也迎来了
放宽口罩禁令后的首个春节，
不少民众返乡、出游；
旅游热门目的地旅馆、民宿订房火爆；
文博机构、宫观庙宇推出新春祈福活动；
灯会、花灯活动陆续开幕
……
快和小新一起感受
岛内红火的年节气氛吧！
过年就要吃吃喝喝
腊月十六，尾牙
闽台地区的民间传统节日
源于拜祭土地公的仪式
是春节庆祝活动的“先声”
公司常在这天宴请员工
图为尾牙宴。来源：台湾《工商时报》围炉，即吃年夜饭
除夕夜 一家人团圆
围坐在放有火锅的桌边聚餐
互相分享去年的经历
暖胃更暖心
图为围炉。来源：台湾《联合报》台湾年夜饭的菜品也讲究好寓意
鸡——富贵吉祥
鱼——年年有余
年糕——步步高升
乌鱼子——多子多福
菜头(白萝卜)——好彩头
乌鱼子白萝卜。来源：台湾《联合报》茄子、玉米、芭乐......
动物园里的小动物
也在大快朵颐
纷纷开启年夜饭“吃播”
高雄市寿山动物园的冠豪猪在除夕享受丰盛的一餐。来源：台湾《联合报》返乡热，旅游旺
2023年春运已启动
在这个团圆的节日
台北桃园机场迎来返乡过年的台胞
从1月19日到30日
累计客流量预估近100万人次
资料图：桃园机场内的旅客。中新社记者 陈小愿 摄还有不少民众选择旅游过节
位于屏东县的垦丁
凭借海滩海景和水上活动
成为一大热门目的地
饭店和民宿订房几近爆满
资料图：垦丁龙磐公园景区。中新社记者 杨程晨 摄传统习俗少不了
置办年货是春节前的一件大事
台北迪化年货大街热闹非凡
花枝丸、牛轧糖、鱿鱼丝应有尽有
人潮涌进 叫卖声四起
资料图：一年一度的台北迪化商圈年货大街吸引了众多市民前往游赏、采购，彩灯彩旗从街头挂到街尾。中新社记者 史元丰 摄走春
即大年初一的出行
许多民众会走进寺庙拜拜
祈求兔年一切顺利
不少寺庙今年也恢复了抢头香
资料图：台北龙山寺内，信众有的持一柱香祈福，有的双手合掌行礼。中新社记者 陈小愿 摄白天赏花
晚上观灯
多肉植物“月兔耳”、“兔子花”仙客来
兔子造型花灯、小提灯
陪伴大家度过一个美丽的春节
图为新北淡水天元宫的樱花。来源：“2023新北莳花好绽 浪漫樱花季”活动官网
2023南投灯会上，“粉红兔兔”从天空向大家拜年。来源：“2023南投灯会”官网新的一年，
盼两岸人员交流尽快恢复正常、
两岸同胞走近走亲！
(中新社微信公众号)
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